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16th,2013 相关标签 蛋白质 平台

随着人体基因组测序工作的完成,目前已知人体的许多基因与肿瘤发生有关,但基因组相对蛋白质组来说要小得多,不能反映整个蛋白质组的情况,出于功能需要,许多蛋白质在翻译中或翻译后会在氨基酸链上共价结合各种非肽类基因,形成如磷酸化作用、糖基化作用、蛋白酶解等翻译后修饰,这些翻译后修饰能显著地影响蛋白质的功能及蛋白质表达,改变细胞或组织的特性。因此,应用蛋白质组学研究技术比较患同一肿瘤的不同个体的肿瘤组织(细胞)之间或同一个体肿瘤细胞与正常起源细胞之间蛋白质在表达数量、表达位置和修饰状态上的差异,可以发现肿瘤相关的特异性蛋白质(也可称作肿瘤标志物),这些蛋白质既可作为肿瘤诊断的分子标记,又可作为治疗和药物开发的靶点。

华牛构建的蛋白质组平台是以鉴定疾病相关的生物标志物和潜在的药物治疗靶标为主要目标,为疾病的早期诊断和个体化治疗提供依据。华牛蛋白质组平台研究的主要内容有:建立各种肿瘤的蛋白质组数据库、寻找肿瘤相关蛋白质、分析肿瘤相关蛋白质的结构和功能,为揭示肿瘤发生的分子机制,以及为诊断、防治和新药开发提供科学依据和靶标。

分析内容:
蛋白质电泳及图像分析

  1. 一维SDS-PAGE和IEF电泳
  2. 二维电泳
  3. 二维温和胶电泳(2D-BN,蛋白质复合体检测)
  4. 等电点测定
  5. Western blot和电转印
  6. 电泳图像分析

蛋白质鉴定

  1. 蛋白质样品制备(组织、细胞、体液)
  2. 酶切(胶内、膜上)
  3. 多肽和蛋白质分子量测定
  4. 分子量分布测定
  5. 多肽和蛋白质的纯度测定
  6. 肽质量指纹图分析
  7. 多肽和蛋白质序列分析(N—端,C—端)
  8. 新蛋白质序列分析
  9. 肽图分析
  10. 精确质量测定
  11. 鸟枪法蛋白质鉴定
  12. 高富集蛋白质鉴定
  13. 蛋白质突变鉴定与验证
  14. 蛋白质组覆盖分析

蛋白质定量

  1. 差异荧光凝胶电泳分析(DIGE)
  2. iTRAQ蛋白质定量
  3. SILAC蛋白质定量
  4. 绝对定量(AQUA)
  5. 无标记蛋白质定量
  6. 蛋白质组学半定量
  7. SILAC-AQUA蛋白质组学定量及目标验证

蛋白质翻译后修饰分析

  1. 二硫键定位
  2. 蛋白质突变点分析
  3. 蛋白质磷酸化位点分析
  4. 糖蛋白分子量分析
  5. 糖蛋白中唾液酸含量分析
  6. 糖蛋白中N-糖含量分析
  7. 泛素化蛋白质鉴定
  8. 蛋白质泛素化位点分析
  9. 泛素链分析


  (本文出自华牛世纪,转载请注明出处)

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